ТехноСводка

Наука

Китайские исследователи создали Pinal — ИИ для дизайна белков по текстовому описанию

Группа исследователей из Китая представила Pinal, инструмент, который создаёт белки с заданной функцией по запросу на естественном языке.

Обычные инструменты дизайна белков требуют глубоких знаний: нужно задавать механизм реакции и положение отдельных аминокислот. Pinal позволяет просто описать желаемую функцию.

Работает он в два этапа. Модуль T2struct переводит текст в структурный «чертёж» в виде токенов с вероятностями, а SAProt-T на основе текста и этого результата строит последовательность аминокислот, заново оценивая варианты в целом. Обучали систему на белковых последовательностях из трёх баз со структурами, предсказанными AlphaFold; в одной только базе было 800 млн пар «ключевое слово — белок». Описания функций дополнительно генерировала языковая модель.

Успешных белков получается немного, и отбирать удачные варианты среди множества неудачных нужно в лаборатории. Отдельно Hugging Face сообщила, что размещает инструмент с похожими возможностями для ДНК.

  • Два этапа: T2struct и SAProt-T
  • Одна из баз — 800 млн пар «ключевое слово — белок»
  • Hugging Face разместила аналогичный инструмент для ДНК

Источники

Текст подготовлен автоматически по материалам источников и может содержать неточности.